V roce 2003 přišel náš klub s novou iniciativou pro nejmenší děti – cyklisty. Vznikla odnož Cyklo klubu Znojmo, zaměřená pro děti, které mají zájem se celoročně věnovat cyklistice. V první fázi se prostřednictvím medií informují rodiče a poté je svolána první schůzka na které jsou přítomní rodiče seznámeni s programem. Hlavním posláním Cyklo klubu Znojmo JUNIOR je připravit sportovní aktivity a seznamovat děti zábavnou formou s pravidly silniční dopravy, první pomocí a základními znalostmi údržby a opravy jízdních kol.